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條形碼的篩選(SW-CJ-1FD應(yīng)用)

返回列表 來源:未知 發(fā)布日期:2020-09-14 13:55【

1 材料與方法


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2 結(jié)果


本試驗對3個候選的 DNA 條形碼片段cpn60、 recA 和ppsA 進行 PCR 擴增和瓊脂 糖 凝 膠 電 泳 檢 測。候 選 基 因 的 長 度 在530bp~1065bp。 其中recA 序 列 最 長,約 為1065bp;ppsA 序 列 最 短,長度約為530bp;cpn60序列長度約為555bp。 GC含量 ppsA 基 因 最 高,為 65%;其 次 是recA 和 cpn60,分別為59.1%和57.2%。序列變異位點數(shù)可 反 映 序 列 的 變 異 程 度,cpn60 變 異 位 點 數(shù) 最 多 (147);變異位點占總長度的比例也最高(27.68%), 顯 著 高 于 recA(12.42%)和 ppsA(2.3%),提 示 cpn60基因可 為 物 種 提 供 更 多 的 鑒 別 信 息。此 外, cpn60基 因 的 PCR 擴增測序成功率也是 最高的 (75.8%),更容易獲得。






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